Он воспитанник футбольной школы Лозанны, где сразу заметили его природный талант, его незаурядность и любовь к футболу. Руководство клуба решило на это таланте заработать и не сыгравший за взрослую команду ни матча, Джонатан отправился в знаменитый немецкий клуб Айнтрахт. Игра сразу не заладилась, тренер не особо верил в молодого игрока и тот, лишь иногда, попадал в состав, да и то, зачастую, в матчах, где результат был заранее предрешен не в пользу клуба из Бундеслиги. Например, так было в домашнем матче Лиги Чемпионов против Коло-Коло, где команда потерпела сокрушительное поражение 0:3, тем не менее, и этот опыт, в дальнейшем, пригодился Джонатану.

В этом же году, он переходит в Морбио и буквально врывается в, находящийся в разгаре, Швейцарский чемпионат. Шесть мячей в тринадцати играх и звание Лучшего новичка и Лучшего молодого таланта - достойная оценка проделанной им на тренировках работы.

В одиннадцатом сезоне, который, по футбольной традиции, новичок должен провалить, Гарсия закрепляет успех и становится одним из лучших защитников по итогам чемпионата.

Двенадцатый сезон, лишь подтверждает класс игрока, пять мячей и четыре голевые передачи в двадцати пяти матчах, плюс заслуженное вхождение тройку лучших центральных зашитников. В этом сезоне произошло и другое знаменательное событие, Джонатан получил приглашение в состав юниорской сборной и успел сыграть за нее в трех матчах.

Нынешний чемпионат Швейцарии в третьем дивизионе - стал лучшим в его карьере, судите сами:

Чемпионат Швейцарии - шесть мячей и три передачи в девятнадцати матчах

Кубок Швейцарии - один гол в одном матче

Юниорская сборная Швейцарии - пять мячей в семи матчах (!)

Как стало известно, Гарсией заинтересовался известный французский клуб Лилль, который в следующем сезоне возвращается в Первый дивизион Франции, но этот интерес, ещё не подтвержден, да и захочет ли он что-либо менять, получая удовольствие от футбола, под руководством отличного тренера Litvik8, который помогает игроку, в полной мере, раскрывать его талант.

Он уехал из Швейцарии - покорять Германский чемпионат, но вернулся обратно - покорив наши сердца.